健四郎

在烈日照耀下的荒漠中，一名男子拖着疲惫的步伐前进，当他走到一个村庄的时候，由於缺水及疲惫而倒了下去，被村人给关进牢房中。在牢中结识了原为小偷，现在也被关在同一间牢房的男孩－巴托，以及看守的小女孩－琳儿。在村中长老的屋中，村人为了确定他到底是不是暴力组织“Z”的成员，脱下了他的上衣检查是否有刺青，但是当长老一见到他胸前呈北斗七星形状的伤痕时，大吃一惊地认为这是不祥的预兆，而将他继续关在牢中。没多久，Ｚ党来袭击这个村子，村中的自卫队被残杀殆尽，琳儿更是被对方的首领抓为人质，以逼迫村民就范。危急之际，破牢而出的健四郎施展北斗神拳摆平了Ｚ党的老大，平安地救出了琳儿，保住了这个村子。之后，健四郎离开了村子，继续他的旅程，巴托因为崇拜健而跟着他走，长老则安慰流泪送别的琳儿：“北斗出现的地方必有乱事，他是为了琳儿而离开的，因为这里是琳儿的村子啊。。。。”

希恩

旅途中健四郎收拾了暴力组织“King”中的黑桃和方块，在King的本部南十字星城中，健四郎解决了嗜杀的梅花，更在King的首领－南斗圣拳的希恩面前用绝招痛宰如肥猪一般的红心。在和希恩的对话中，说明了两人为何由好友变为仇人，最后希恩在死前说出健四郎的未婚妻－尤莉亚已死的消息，使得这场因爱而生的决斗画下了休止符。

健和巴托停留在一间颇具规模的交换站，巴托偶然看见琳儿被关在由以前特种部队所组成的“神国”的卡车中，在救出琳儿后，健四郎顺道去毁掉“神国”这个组织。善后工作完成后，他们来到了巴托的故乡，帮助巴托的义母朵洋婆婆挖好水井。就在健四郎离开后，飞车党头目傑卡鲁来犯，朵洋婆婆为了保护孩子而死，健四郎大怒，誓杀傑卡鲁报仇！

经过一连串的猎杀，被逼到走投无路的傑卡鲁决定到雷比尼监狱放出号称“不死恶魔”的重刑犯来对付健四郎，虽然对方为恶魔的化身，但是仍不敌战神化身的健四郎，和傑卡鲁一同到阴间报到。

玛雅

为了使朵洋婆婆所收养的孩子有人收留，健四郎受某村落之託消灭来犯的“牙一族”，为此认识了南斗六圣拳之一“南斗水鸟拳”的雷依，以及酷似尤莉亚的玛雅。由於玛雅的弟弟被牙一族所杀，为了玛雅的泪水，两人联手消灭了牙一族的先锋部队。牙一族的首领为了报复，利用雷依失散的妹妹艾丽作人质，逼使健四郎和雷依相斗，不过两人以诈死来瞒过牙一族的首领，成功地救出了人质。

傑基

由艾丽的口中得知，有人以“胸前有七个伤痕的男人”为名，四处残害无辜的民众，破坏北斗神拳的名声，健四郎为了善尽北斗神拳继承人的职责，启程讨伐他那不成材的三哥－傑基。

从傑基的口中得知，当初希恩之所以会自他身边夺走尤莉亚，完全是受到他的煽动，健四郎怒不可遏，让他的肉体自地球上消失掉。傑基在临死之际，告知健四郎他的两个哥哥还活着，健四郎震惊，心想：“我一定要去见他们，特别是道奇，我非见到他不可。。。。”

在一间酒馆中听到有关“道奇突然变成杀人鬼”的传闻，健四郎抱着疑问前往求证，在亲眼目睹道奇的人体实验后，健四郎悲愤地决定打倒道奇，但是面对自己一向敬爱的二哥，健四郎却下不了杀手，反而被点中穴道而动弹不得。危急之际，雷依赶来揭穿道奇的真面目，原来他是南斗圣拳一派的安信，受到世纪末霸主“拳王”的命令，假冒道奇之名研究人体身上的经脉穴道，面对这个破坏二哥及北斗神拳名誉的安信，健四郎不客气地送他到地狱去忏悔，不过对於道奇的下落更是耿耿於怀。

道奇

经过玛雅的探访，查出道奇被关在卡山多拉监狱，於是健四郎和雷依、玛雅一同往卡山多拉监狱出发。通过了守卫大门的拉卡、呼卡兄弟，健四郎对上了典狱长维吾尔，一番战斗之后，典狱长被送进了一旁新挖的墓穴。此时拳王亲卫队出现，欲将道奇移至他处，拉卡和呼卡为守住通往道奇牢房的通道，撑着落下的巨石而死，健四郎誓为他们复仇。拳王亲卫队眼看已来不及带走道奇，决定杀掉他，但是他们根本不瞭解北斗神拳的道奇，反而死在道奇的手下。兄弟相会，简短的问候取代了千言万语，却在此时，骑着巨马的拳王身影出现在琳儿他们所在的村子附近。。。。

雷依

先赶回的雷依在村外遇见负伤出来求援的巴托，回到了村中，又看见被打伤的琳儿，愤怒之火使得他当场令一些拳王的部下变成碎块，但是面对拳王压倒性的强势，雷依就算是用尽全力也无法伤他，反被点中“心血愁”穴道，使其

拉欧

生命仅剩下三天。健四郎赶到，欲和拳王（也就是他的大哥拉欧）打斗，不过却被道奇阻止；道奇点了健四郎的穴道，要健四郎仔细看着他和拉欧的战斗，以从中领悟“柔拳”的精髓，因为“刚拳”对“刚拳”的战斗往往会导致玉石俱焚。道奇虽舍命一战，但久病的身体却支持不住，眼看道奇就要死在拉欧的手里，玛雅打算箭射拉欧，雷依阻止道：“北斗神拳二指真空把的绝技会使箭射回自己！”玛雅无奈道：“可是只剩我能出手了。”毅然扣下十字弓的板机。拉欧不顾雷依的求情，将箭射回玛雅，此时健四郎终於奋力冲破被道奇所点的穴道，挡住了这一箭，和拉欧展开了一场血淋淋的肉搏战。

激战过后，只方都被对方的拳术给制住了，道奇分开了两人，说道：“你们自己应该很清楚自己已经不能再打斗了。”拉欧的部下早已逃得一个不剩，他孤独地骑着巨马“黑王”离去。